En la entrada al Museo encontramos la Recepción y la tienda del museo souvenirs donde os podréis llevar algún recuerdo del Museo o de Málaga. El Museo Alborania se trataba de un proyecto creado por un grupo de estudiantes malagueños, cuyo principal objetivo era interpretar el medio marino para divulgarlo y así favorecer su protección y conservación.
Con este fin se acondicionaron varias salas, cedidas por la Cofradía de Pescadores de Málaga, para la realización de actividades de educación ambiental y dotadas de una exposición permanente con acuarios marinos representando los diferentes hábitats y ecosistemas del Mar de Alborán, así como maquetas y vitrinas con caparazones y conchas de animales marinos, o piezas relacionadas con la pesca, náutica, arqueología submarina y acuicultura.